Juan José Santibáñez estudió la licenciatura en arquitectura en la Universidad Popular Autónoma del Estado de Puebla.
Fue ganador de la beca “ Creadores Intelectuales 1989” otorgada por el FONCA, Fondo Nacional para la Cultura y las Artes con el tema: arquitectura regional en la mixteca.
En 1996 estudio el Curso:”Gaudí y arquitectura de la naturaleza” en la real academia catalana de bellas artes de San Jordi, Barcelona España y en ese mismo año visito Marruecos.
En 2007 fue ganador del premio CEMEX en la categoría de Congruencia en accesibilidad con el proyecto presentado en esta revista.
El año pasado fue ganador de la medalla de plata en la categoría de Restauración en la X Bienal de Arquitectura Mexicana con la obra Museo Textil de Oaxaca.
Su proyecto más reciente, es la Universidad la Salle de Oaxaca, en Xoxocotlán, Oaxaca que este año ha iniciado la construcción de su primer etapa.